以氨氮形態存在的氮稱為氨氮。在水體中氨與水結合生成水合氨，也稱為非離子氨。非離子氨是引起水生物毒害的主要因子。是國家列入地面水環境質量標準中的重要項目。2 類地面水，規定要求非離子氨氮(NH3-N)的濃度≤0.5mg/L。

對人體健康影響，水中的氨氮可以在一定條件下轉化成亞硝酸鹽，亞硝酸鹽將和蛋白質結合形成亞硝胺，這是一種致癌物質，如果長期飲用，對人體健康極為不利。

動物性有機物的含氮量一般較植物性有機物為高；人畜糞便中含氮有機物容易分解成氨。上述污染物會使水系氨氮含量增高。